Профлист, это материал (кровельный, в Вашем случае) изготовленный из листового металла (тонкого) путем штамповки.
Вот так он выглядит
есть выбор по цвету.
Качество этого изделия может быть разным, возможно купили бюджетный вариант профлиста (или использовали б\у профлист).
Возможно защитное покрытие профлиста не качественное отсюда и проблемы.
Если проще, то лист ржавеет, хотя у качественного материала такого быть не должно, если конечно профилист не получил механические повреждения при установке.
Дальше, во время монтажа, или по иным причинам (сильный ветер, как вариант) профлист получил точечные повреждения, появились протечки, то есть нарушены целостность листа (покрытия).
Нужен осмотр кровли, и далее ремонт, возможно и локальный, или замена отдельных листов (поврежденных) на новые.
У себя на даче, при ремонте "пробоин" на профлисте я использовал специальную герметизирующую ремонтную, кровельную ленту, профилист не менял.
Возможно при транспортировке профилистов было повреждено верхнее защитно-декоративное покрытие (а оно разное), на профилисте появились следы коррозии что в дальнейшем, могло привести к протечкам.
Не правильно крепили профилист, возможно использовали не тот крепеж, нужны кровельные саморезы с прокладкой (шайбой с резиновой прокладкой, так точней), возможно из-за неподходящих метизов, протечки в районе установки саморезов.
Саморезы нужно менять и обратите внимание на шаг между саморезами.
Или саморезы "правильные" (подходящие) , но их неправильно закручивали в профлист, например под углом, или саморезы не докрутили, или наоборот перетянули деформировав, профилист, то есть ошибки монтажа отсюда и протечки.
Возможно нарушена целостность гидроизоляции кровли, бывает и такое, вода попадает под кровельный материал.
А возможно причина в конденсате, были допущены ошибки при монтаже паро и гидроизоляционных материалов, не уделялось внимание вентиляции под кровельного пространства.
Возможно причина протечек в неграмотной, неправильной установке мансардных окно, если конечно они есть.
Есть и другие причины, например неправильный (недостаточный) нахлест при укладке (монтаже) профлиста, не учитывался уклон кровли, кровля повреждена градом и.т.д.
