Водостойкий плиточный клей влагу не пропускает, он её "держит" не хуже затирки на цементной основе.
Другое дело что внешний вид швов, может не нравится, швы "пористые", а не гладкие.
Или швы узкие (например использовали дистанционные крестики размером 1-1,5 мм), а составе плиточного клея есть кварцевый песок, в составе затирки для узких швов его нет.
Швы лучше очищать до того как клей высохнет, если уже высох, можно попробовать удалить клей при помощи вот такого
скребка (его обычно используют для очистки швов, от затирки на цементной основе).
Работа трудоемкая, особенно если плитка не большого формата и швов много.
Если швы широкие, миним 2,5-3 мм, то процесс можно механизировать, швы очищаются при помощи УШМ (болгарка), к Болгарке понадобится приобрести тонкий алмазный диск, толщиной не более 1,5 мм.
Работать нужно аккуратней чтобы не повредить плитку.
Обороты на УШМ, устанавливайте минимальные, пыли будет много, но есть насадки на УШМ с возможностью подключения пылесоса.