Конечно последовательность проведения работ нарушена, ибо в начале выравниваются стены, затем монтируется натяжной потолок и лучший выход в Вашей ситуации демонтаж натяжного потолка.
Но если без демонтажа, то выход есть (правда тут чётко надо знать насколько стены не ровные), что бы скрыть тот самый слой, шпаклёвки в местах примыкания его к натяжному потолку, надо приобрести широкий потолочный плинтус (багет).
Багет клеится к стене, к потолку, или точечная фиксация, или вообще без неё.
Делаем разметку по ширине багета, приставив его к поверхности.
Проводим линию по периметру помещения.
Убираем старую отделку, грунтуем и просушиваем стены.
Если надо устанавливаем маяки, натяжной потолок защищаем малярной лентой (по периметру).
Далее наносим слой стартовой шпаклёвки.
Просушка, грунтовка с просушкой.
Затем финишная шпаклёвка, в месте где будет закреплён багет, шпаклёвочный слой выводим на нет.
Всё, крепим багет.
Все работы надо выполнять крайне аккуратно, если полотно ПВХ на потолке, оно крайне не устойчиво к механическим воздействием, его можно порезать, порвать и.т.п.
Тканевые натяжные потолки чуть более прочные.