Здесь все зависит от политики компании. Если рассматривать правовой вариант, то вы заплатили за окна с подоконниками и вам поставят окна с подоконниками, а бракованные заберут с собой. Но обычно, если подоконники не пригодятся фирме, то их могут оставить или просто выбросить, так сказать не вам, не нам. Если вам они нужны, то можно попытаться договорится с мастером о покупке по скромной, символической цене, выгодной для вас.