В общем-то не до конца понятна проблема.
Вертикаль при монтаже углов каркаса можно "поймать" уровнем, можно использовать угольник, ведь угол между угловой стойкой и брусом обвязки должен быть прямым.
Если в целом, то при строительстве каркасного дома, все этапы прочно завязаны между собой.
Вы делаете (заливаете) фундамент в опалубку, вот на этой стадии (сооружение опалубки) сразу же учитывается геометрия будущего строения (если ещё точней, то разметка фундамента, вот отправная точка).
При заливки фундамента в него монтируются шпильки для крепления нижней обвязки.
После того как фундамент полностью набрал прочность, делается гидроизоляция, далее монтаж брусков нижней обвязки.
А дальше как хотите, можете полом заниматься, можно сразу делать каркас под стены.
Брус нижней обвязки, как и лента фундамента в горизонте, то есть если всё сделать правильно, то с вертикальностью установки угловых брусков вообще проблем не возникнет.
Угловые бруски крепятся по разному и уголками и при помощи нагелей и.т.д.