Если в целом, то технологические отверстия под канализацию, водопровод, если электроснабжение будет в траншее (чаще воздушное от столба к дому), то под вводной кабель тоже надо оставлять отверстия.
Если отопление будет центральным, то и под эти трубы оставляем отверстия.
В цокольной части фундамента отверстия под продухи,
газовая труба может идти через цоколь.
Если заземляетесь (делаете контур заземления возле дома), то возможно и под него нужно отверстие.
А вообще всё делается совершено по другому, "на глаз" никто никакие отверстия не оставляет.
Для ввода коммуникаций нужны разрешения, место ввода коммуникаций в дом указаны в проекте.
То есть может получиться так что технологические отверстие в одном месте фундамента, а ввод разрешили в другом.
При обустройстве канализации надо учитывать требования СНиПов касательно местоположения выгребной ямы, глубину промерзания грунта в Вашей местности (возможно канализационная, или водопроводная труба пойдёт под фундаментом и не нужны никакие отверстия в фундаменте) и так далее включая уклоны, не зная уклон в привязке к длине трассы, сложно определиться где делать технологическое отверстие в фундаменте.
Надо чётко знать какого диаметра канализационные трубы будем использовать (нужны расчёты по водоотведению, учитывается количество жильцов, количество сантех-приборов, интенсивность их использования и отталкиваясь от этого подбирается диаметр труб канализации).
Дом хоть и частный, но копать траншеи где удобно нельзя, можно повредить уже имеющиеся коммуникации.
Если дом возле дороги, то и с ГАИ надо этот вопрос согласовывать.
Вообще правильно, это дом (и фундамент под ним) строящийся по проекту.
Все блага цивилизации должны быть в доме, вот под них и оставляем отверстия.
Учитывайте что и внутренние несущие стены могут быть в доме, возможно и в фундаменте под эти стены так же необходимы отверстия (под продухи это само собой, но возможно и под канализацию).
Если в доме русская печь, под ней свой фундамент и это надо учитывать (что бы не упереться коммуникациями в фундамент печи) делая отверстия в фундаменте, для всего этого и делается (заказывается) проект.