Я так понял что речь о трубе дымохода на крыше, то есть наружные работы.
Труба дымохода не разогревается до каких-то критических температур, тут достаточно "классической" штукатурки для наружных работ.
То есть цемент + песок, пропорции один к трём (три части сеянного песка).
После просушки штукатурки её можно покрасить, к примеру силиконовой краской, она (краска) на годы защитит штукатурку от неблагоприятных внешних факторов.
Если слои большие, то можно штукатурить по сетке.
В продаже есть и готовые смеси, но это довольно дорого.
Некоторые обмазывают кирпичную трубу жаростойким плиточным клеем, тоже вариант.


Возможно не совсем правильная подготовка.
Помимо тог что необходимо убрать старую штукатурку, ту которая отслаивается, швы надо очистить и чуть углубить.
Грунтовка с полной просушкой, всё можно штукатурить и ни куда она не денется, если пропустили хотя бы один пункт (см. выше о подготовки), то будут проблемы.