Чем покрыть пол на застеклённой лоджии?

Вот этот момент не совсем правильный, если быть откровенным, то совсем не правильный.

Окончательная отделка стен лоджии подразумевает монтаж плинтусов, а плинтуса монтируются на готовый пол, не важно из какого он материала.

Надеюсь что Вы просто ошиблись с формулировкой и плинтуса пока не устанавливали.

Из Вашего вопроса я понял что лоджия утеплена, но не отапливается.

Из этого можно сделать вывод что вариант с ламинатом вообще не вариант.

К самому большому минусу ламината относится его не долговечность, а в условиях где "царит" перепад температур он вообще проживёт совсем не долго.

Из двух вариантов, над которыми Вы думаете остаётся линолеум.

Вроде не плохая идея, но и линолеум предпочитает лежать на поверхности которая не подвержена перепадам температуры.

В зимний период в районе дверей, он может пойти "волнами", плюс так называемая "дорожка" от потёртости, образуется очень быстро.

Я бы Вам посоветовал остановиться на кафельной плитке.

Плитка совершенно не боится влаги, она устойчива к температурным перепадам, её легко мыть.

Из всех вариантов кафель дороже предыдущих, но если смотреть с прицелом на годы, то в итоге выйдет одна сплошная экономия.

Причём кафель довольно легко комбинируется со стеновыми панелями, которыми Вы "отделали" стены на лоджии.

При желании и некоторых материальных затратах, можно под кафелем сделать тёплый электрический пол, правда всё это делается до отделки стен.