То что дом деревянный, не совсем важно, гораздо важней определиться в какой комнате будет установлен увлажнитель.
Если это детская комната, то помимо того что это электроприбор и рядом с увлажнителем должна быть розетка, надо ещё учитывать что бы ребёнок до него не дотянулся.
Ребёнок может просто обжечься струёй пара (если это паровой увлажнитель) выходящей из увлажнителя.
Логично установить увлажнитель на полку, если конечно его габариты и вес позволяют.
Можно на шкаф до которого не дотянется ребёнок.
Если это не детская комната, то увлажнитель лучше устанавливать на некотором расстоянии от поверхности пола, минимум это 500-т мм, лучший вариант метр.
Можно под прибор выделить, или купить отдельный стол, или тумбу.
Если работает отопление, то логично ставить увлажнитель на не большом расстоянии от батареи, увлажнитель будет увлажнять через чур сухой воздух исходящий от радиаторов отопления.
На подоконник не советую устанавливать прибор, минимальное расстояние от батареи не должно быть меньше 300-т мм