Честно говоря не до конца понимаю суть происходящего.
Вы пишите о жилой квартире, а дальше о перепланировки в нежилом помещении.
Получается что Вы квартиру уже перевели в нежилой фонд и только после этого делаете перепланировку?
Или квартира жилая и Вы делаете перепланировку?
Это важные моменты, хотя почти оформление перепланировки схоже.
Так же важно знать чем конкретно будете заниматься в нежилом помещении которое находится в жилом здании.
Вы пишите что офис, значит нужна дополнительная звукоизоляция, освещение, есть требования по количеству туалетов на количество людей работающих в офисе, есть требования связанные с вентиляцией (высчитывается потребление свежего воздуха каждого человека в час) и так далее.
Ну а в общем, всё как обычно, первый шаг это проект.
Дальше утверждение проекта в органах государственной власти (в Горсовете к примеру), далее работы по перепланировки, по ходу получаем "добро" от МЧС (пожарники) Электросети, Теплосети, СЭС, возможно потребуются разрешения и от иных организаций (см. выше о сфере деятельности).
Если Ваше не жилое помещение (квартира) затрагивает интересы остальных собственников жилого дома, то надо получить подписи (разрешение) как минимум от 80% проживающих.
Вы пишите об отдельном входе,
это изменение фасада здания, в Горсовете есть архитектурный отдел, он может дать, или не дать (к примеру если фасад выходит на центральную улицу) разрешение на обустройство отдельного входа.