Если речь о финишном напольном материале, то в принципе нет никаких ограничений связанных с деревянным домом.
Материал выбирается с учетом условий эксплуатации в конкретном помещении.
Например если это помещение с повышенной влажностью, то на деревянное основание можно и керамическую плитку
и керамогранит уложить.
Если плитку укладываете на фанеру (фанера крепится к лагам) то рекомендую определиться с толщиной фанеры и уменьшить шаг между лаг.
Помимо плитки, в помещениях с нормальной влажностью, можно уложить паркет, или паркетную доску (это разные материалы).
Пробковые полы, ламинат, линолеум, ковролин, половая доска, например шпунтованная.
Более бюджетный вариант, фанера укладывается на лаги и далее окраска фанеры на финише, краска нужна половая (она устойчива к истиранию).
Предварительно швы между листами фанеры, шпаклюются.
Если речь о выравнивании основания, то основание можно выровнять бетонной, или цементно-песчаной стяжкой и даже в деревянном доме, вот фото
для наглядности.
Рекомендую не классическую "мокрую" стяжку, а полусухую с минимальным количеством воды в растворе и не забываем о демпферной ленте по периметру помещения.
Также в деревянном доме можно сделать сухую стяжку, между профилями засыпается керамзитовый песок (как вариант) к профилям крепятся листы ГВЛ (это гипсоволокнистый лист), при необходимости листы ГВЛ можно уложить и в два слоя, со смещением по швам.
На ГВЛ можно уложить и плитку и паркет, ламинат, линолеум и.т.п.