Насколько мне известно, на соединениях желобов должны находиться резиновые уплотнители. А когда система плохо собрана тогда она не плотно сидит и может протекать, или там нет уплотнительных резинок.
Если желоба плохо собраны (плохо застёгнуты) - можно обойтись и без демонтажа, а в других случаях надо делать демонтаж. А герметизировать лучше всего кровельным герметиком.