

Вы знаете, Вы и так выбрали не самый подходящий материал под кафель, а тут ещё перепады высот.
Фанера под плиткой не должна быть тоньше 18 мм, причём фанера должна быть влагостойкой.
В Вашем случае к купленной фанере в 12 мм, надо добавить такую же, и класть фанеру в два слоя.
Если тот самый "перепад высот" не позволяет это сделать, то вообще откажитесь от кафельной плитки.
На фанере толщиной в 12 мм, она упадёт через пару недель.
Цельные листы фанеры распускайте на четыре части, крепите к полу (Вы пишите о том что у Вас пол деревянный) саморезами, шаг между саморезами 20-30 см, саморезы не жалейте.
Между листами фанеры не большой зазор.
Второй слой фанеры укладывайте не стыком с первым (слои укладываются в разбежку), затем так же саморезы.
Фанеру перед облицовкой необходимо загрунтовать.
Я грунтую плиточным клеем, просто втираю клей в фанеру, после этого жду полного высыхания, затем приступаю к облицовки.
Советую класть на клей Ceresit (Церезит),
можно СМ-11, или СМ-17.
Швы желательно делать не слишком широкими, достаточно 1.5, или 2-х миллиметровых крестиков.
А вообще, если делать основательно и как говорят "по уму", то надо вскрыть полы и посмотреть на лаги, если они в плачевном состоянии, то начинать работы надо именно с этого (устранять плачевное состояние).


Фанера лучше, но с учётом того о чём написал выше.