Вариантов несколько, всё зависит от объёма работ.
Можно удалить механическим путём при помощи металлической щётки, или наждачной бумаги, или дрели (болгарки) а насадками для шлифования.
Так же важно учитывать где в дальнейшем будет использоваться арматура.
Если для изготовления неких железобетонных изделий, или при заливки фундамента (при его аминировании), объёмы большие, в этом случае лучше использовать преобразователь ржавчины.
Лучше бескислотный, он не оказывает отрицательного воздействия на бетон (не разрушает его).
Вот такой преобразователь ржавчины, специально разработан для очистки арматуры от ржавчины "Армасил".
Не требует промывки после просушки, удаляет даже толстые слои ржавчины, полностью заменяет механическую очистку.
Наносить можно кистью, валиком, методом распыления.
Если слой ржавчины очень большой, то стержни арматуры обрабатываются дважды.
Вылейте преобразователь в тару и далее кистью наносим его на арматуру, всё после высыхания преобразователя арматуру можно закладывать в бетон, или покрасить, смотрите уже по месту.