Вариантов несколько, многое зависит от того времени которое у Вас есть.
Первый вариант это стяжка, убрали быль, грунтовка, просушка.
Маяки, стяжка, если полы сильно кривые (толстая стяжка), то армирование.
После просушки стяжки, опять грунтовка с просушкой.
Далее кладём плитку как обычно, если это ванная комната, или туалет, то рассчитываем таким образом что бы у выхода (входная дверь) была целая плитка, кафель режется плиткорезом,
или болгаркой с алмазным кругом.
Клей наносится на поверхность в начале обычным шпателем, далее "волны" формируются зубчатым, между кафелем вставляем крестики.
После того как плиточный клей высохнет, очищаем и затем затираем швы фугой (затирка для швов).
Второй вариант подойдёт если основа под неровными полами прочная и та самая неровность не очень большая (до см).
В этом случае вместо грунтовки лучше использовать плиточный клей, но более жидкой консистенции.
Втираем его (жидкий плиточный клей) в полы и даём полную просушку.
Далее работаем индивидуально с каждой плиткой, клей накладывается на кафель, горизонт пробиваем уровнем.
Есть ещё вариант выравнивания пола гипсокартоном на этот же плиточный клей.