Если это просто ржавчина, то можно взять щётку по металлу и очистить ржавчину с трубы. Затем подкрасить место зачистки.
Однако, ржавчина на соединении батареи и трубы отопления обычно возникает по причине появления свища-небольшой дырочки в трубе. При очистке ржавчины можно получить течь воды из системы отопления со всеми радужными последствиями. Поэтому лучше производить данную работу не в отопительный период, а если всё таки пришлось - имейте в запасе хомут и кусок резины.