

Думаю что причина вот в этом узле.
То что на стекловате рубероид это хорошо, но стекловату нельзя было класть на "голую" бетонную плиту.
Пирог должен быть иным, под стекловатой гидроизоляция (рубероид к примеру), а над стекловатой паро-изоляция (это разные вещи, не дорогая паро-изоляция это пергамин.
Если чердак не жилой, то "пирог" иной, паро-изоляция от помещения (под стекловатой) а сверху стекловаты гидроизоляция, получается что Ваш утеплитель не защищён от плиты снизу.
Вот схема "пирога",
как Вы видите утеплитель должен быть защищён с облоих сторон, только в этом случае он не намокнет.
Не совсем логично использовать два разных утеплителя в одном "пироге", лучше определиться заранее, или керамзит, или стекловата.
Вам надо разобрать весь этот узел, намокшую стекловату выкинуть, проверить крышу на протекание, если есть проблемы, устранить.
Обработать стены, потолки средством от грибков и плесени.
И только после этого утеплять перекрытие, но уже правильно.