Рейками в смысле вагонкой или отделочной доской? Я вас правильно понял? В принципе совершенно без разницы, как вам нравится, так и поступайте.
Вагонкой или отделочной доской обычно обшивают вертикально, кое-кто из вагонки создаёт целые узоры, гораздо реже горизонтально, а вот блок-хусом (это такая разновидность вагонки с округлой наружней стороной, имитирующая в той или иной степени бревно), то обычно горизонтально, это смотрится более эстетично и привычно глазу.
А так конечно же выбор за вами и только вам решать, что будет радовать ваш глаз.