Вы пишите о бетонном полу и линолеуме.
Тут есть свои нюансы.
Что бы вывести грибок под линолеумом, линолеум надо снять и это минимум, ещё лучше заменить полностью, дело в том что грибок поразил и линолеум,
бороться с этим не имеет смысла, да и не получится.
Под линолеумом поверхность (тот самый бетонный пол) не "дышит", нет циркуляции воздуха, поэтому не убрав линолеум ни чего сделать не получится.
Убрали, механическим путём (щётки, тряпки) удалили значительные поражения и далее к примеру используем медный купорос 100-о грамм на ведро, можно даже отбеливателем обойтись.
Все эти работы производятся в хорошо проветриваемом помещении.
Можно приобрести специальное средство уничтожающее грибок и плесень, вот к примеру такое "Ceresit CT 99",
работает и по бетону.
Средство концентрат, пропорции на таре (если бетон сильно поражён грибком, то 1:2), разводится водой.
Развели и кистью нанесли на поражённую поверхность, равномерным слоем.
Примерно через 12-ь часов, загрунтовали полы, просушили и можно класть новый линолеум на клей.
Ну и конечно проверьте работе вентиляции, просушите квартиру после потопа (Вы об этом пишите), повышенная влажность хорошая среда для грибка и плесени.