Сразу же хочу отметить, если не помогает длительное проветривание избавиться от запаха, то проблему нужно решать кардинально.
Но в начале пробуйте проветрить помещение.
Запах плесени говорит о том что плохо работает вентиляция, плохо вентилируется подпол, возможно древесина сгнила, отсюда и запах.
Полы нужно вскрывать, осматривать лаги, при необходимости лаги нужно заменить.
Перед монтажом лаг древесина пропитывается вот такими
специальными огнебиозащитными пропитками.
Если нужно сэкономить, то хотя бы дерево нужно проолифить, олифа натуральная перед нанесением разогревается на водяной бане.
Возможно доски и лаги изготавливались из сырой древесины, и в этом случае каким либо образом "запереть" запах не получится, даже окраска полов не поможет.
То есть Вам нужно в первую очередь убрать доски и далее принимать решение по ситуации.
Просушить подпол, заменить сгнившие лаги, убрать плесень, улучшить вентиляцию подпола.
Если под полом укладывался утеплитель, посмотреть в каком состоянии он находится, возможно проблем а в нём.


Это и есть причина сырости и как её следствие появление плесени, запаха.


Пробуйте "запереть" запах покраской половой доски, можно купить масляную краску для пола, она после высыхания создаёт на поверхности защитную плёнку которая может "запереть" запах".
Такую краску можно нанести даже без тщательной предварительной подготовки поверхности, достаточно просто хорошо помыть полы, просушить.
Если старая краска отслаивается, удаляем её.
Минус масляной краски она долго сохнет и у ней резкий запах, но после просушки запах удаляется проветриванием.