Обычно гидроизоляция укладывается, или наносится под деревянный пол, а не сверху.
Финишное деревянное покрытие, в моем случае, это шпунтованная доска, окрашивается, краска половая влагостойкая, это декоративно-защитный состав.
В моем случае полы утеплялись минеральной ватой.
Уложил рулонную гидроизоляцию (рубероид) с нахлестом на стены, далее минеральная вата. сверху пароизоляционная мембрана и на финише к лагам крепил половую доску.
Если решили залить стяжку на деревянное основание, также можно использовать рубероид, или битумную мастику.
Рубероид укладывается с нахлестом между листами и с нахлестом на стены.
По периметру крепится демпферная лента, выставляются маяки и заливается стяжка, при значительной толщине, стяжка ещё и армируется.
Есть ещё вариант использования "жидкой резины" вот
не плохая "Gloss (Капитель)".
Это гидроизоляционный материал наносится и на древесину в том числе, помимо прочего это ещё и био-защита древесины.
Поверхность должна быть сухой, очищенной от пыли и грязи и загрунтованной.
Наносится кистью, или валиком, слой равномерный.