На мой взгляд, лучше просчитать ситуацию заранее (так будет правильно).
Если Вы собираетесь клеить обои на стены, то сразу учитывайте какие это будут обои.
Если тонкие (бумажные), то лучше и штукатурку и шпаклёвку использовать на одной основе, например гипсовые штукатурки и гипсовые шпаклёвки белого цвета, цементные, серого.
Гипсовую штукатурку можно затереть пока она не высохла (по мокрому) и тем самым обойтись без шпаклёвки вообще.
Я под плотные обои использую вот такую
гипсовую штукатурку "Ротбанд" и финишная шпаклёвка не нужна.
У "Волма" тоже есть такие штукатурки (гипсовые) которые не требуют нанесения финишной шпаклёвки и тем более под обои.
Скорей всего Вы штукатурили цементно-песчаной штукатуркой, а шпаклевали гипсовой, отсюда и проблемы.
Чтобы "перекрыть" просвечивающуюся штукатурку можно сделать следующее:
Убираем пыль с поверхности, грунтуем стены с просушкой, наносим тонкий слой финишной шпаклёвки, далее просушка, шлифовка и грунтовка с просушкой под обои, или покраску.
Если этот вариант не подходит, то поверхность можно окрасить, подготовка та же, в некоторых случаях можно обойтись без грунтовки, первый слой краски будет грунтовочным.
Если используете водоэмульсионные краски, разводим её водой (но не более 10-15% от общего количества краски) далее окрашиваем поверхность с просушкой.
После того как краска высохнет, грунтовка с просушкой под обои.


Если стены ровные на таком минимальном слое финишной шпаклёвки (штукатурка просвечивается через шпаклёвку), то штукатурка затирается и обои клеятся без слоя финишной шпаклёвки.


Купите более плотные обои, под ними штукатурка просвечиваться не будет, покупка иных обоев более правильный вариант чем покраска стен.
Или же воспользуйтесь старым Советским способом подготовки стен под обои, помимо выше предложенных вариантов, стены можно оклеить газетами и обои клеить на газеты.
Но я бы настоятельно посоветовал купить другие обои, можно под покраску.


Насчёт разбавления, всё правильно Вам посоветовали, а вот закрашивать только пятна, я бы не советовал, стену придётся красить всплошную (всю), а не локально, поэтому более плотные обои оптимальный вариант.